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1、GST pull-down一般指用一个带GST标签的重组蛋白，与目的蛋白进行孵育，最后用结合GST的Beads拉下相互作用复合物。

2、免疫共沉淀一般是用某一蛋白的抗体，在细胞裂解液中与相应的蛋白结果，用Protein A/G将抗原抗体复合物拉下，最后在拉下的复合物中检测目的蛋白的实验。

3、二者都是用于检测蛋白相互作用的实验。

4、区别是pull-down一般是验证 体外 相互作用；免疫共沉淀一般用于检测细胞水平的 体内 相互作用。

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